Főigazgatóság Állattár Ásvány- és Kőzettár Biztonsági Osztály Embertani Tár Gazdálkodási és Pénzügyi Osztály Gazdasági Igazgatóság Informatikai Főosztály Kiállításrendezési Osztály Közművelődési Osztály Közönségszolgálati Csoport Központi könyvtár Marketingcsoport Molekuláris Taxonómiai Laboratórium MTA-MTM Állatökológiai Kutatócsoport MTM Bakonyi Természettudományi Múzeuma, Zirc MTM Mátra Múzeuma, Gyöngyös Műszaki és Üzemeltetési Osztály Növénytár Őslénytani és Földtani Tár MTA–MTM-ELTE Paleontológiai Kutatócsoport
